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姓 名:
张秀军
性    别:
职 务:
职    称:
青年研究员
学 位:
博士
通讯地址:
中国科学院武汉植物园
电 话:
027-87518696
邮政编码:
430074
传 真:
电子邮件:
zhangxj@wbgcas.cn

导师简介:


简要履历:

2009.09-2013.07 上海大学,生物信息学与系统生物学 博士  

2011.05-2013.05 法国昂热大学,联合培养博士  

2013.09-2014.03 美国加州大学洛杉矶分校,博士后  

2014.05-2016.08 新加坡南洋理工大学/新加坡基因组研究所,博士后  

2016.08至今,中国科学院武汉植物园,课题负责人  


研究领域:

生物信息学、植物基因组学、计算生物学、系统生物学。



社会任职:


获奖及荣誉:


代表论著:

[1] Juan Zhao, Yiwei Zhou, Xiujun Zhang, Luonan Chen. Part mutual information for quantifying direct associations in networks. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 113(18): 5130-5135, 2016. 

[2] Kaiwen Ivy Liu,Muhammad Nadzim Bin Ramli, Cheok Wei Ariel Woo, Yuanming Wang, Tianyun Zhao, Xiujun Zhang,Guo Rong Daniel Yim, Bao Yi Chong, Ali Gowher, Mervyn Zi Hao Chua, Jonathan Jung, Jia Hui Jane Lee, Meng How Tan. A chemical-inducible CRISPR-Cas9 system for rapid control of genome editing. Nature Chemical Biology, 12,980–987, 2016. 

[3] Guangyong Zheng, Yaochen Xu, Xiujun Zhang, Zhi-Ping Liu, Zhuo Wang, Luonan Chen and Xin-Guang Zhu. CMIP: a software package capable of reconstructing genome-wide regulatory networks using gene expression data. BMC Bioinformatics, 17(17): 137, 2016. 

[4] Xiujun ZhangJuan Zhao, Jin-Kao Hao, Xing-Ming Zhao*, and Luonan Chen*. Conditional mutual inclusive information enables accurate quantification of associations in gene regulatory networks. Nucleic Acids Research. 43 (5): e31, 2015. 

[5] Rosa Aghdama, Mojtaba Ganjalia, Xiujun Zhang* and Changiz Eslahchi*. CN: A Consensus Algorithm for Inferring Gene Regulatory Networks Using SORDER Algorithm and Conditional Mutual Information Test. Molecular Biosystems, 11(3):942-9, 2015. 

[6] Xiujun Zhang, Keqin Liu, Zhi-Ping Liu, Béatrice Duval, Jean-Michel Richer, Xing-Ming Zhao*, Jin-Kao Hao* and Luonan Chen*. NARROMI: a noise and redundancy reduction technique improves accuracy of gene regulatory network inference. Bioinformatics, 29(1), 106-113, 2013.   

[7] Xiujun Zhang. Evolution algorithm based transcription regulatory network construction. Encyclopedia of Systems Biology, Springer, 693-695, 2013.  

[8] Xiujun Zhang, Xing-Ming Zhao, Kun He, Le Lu, Yongwei Cao, Jingdong Liu, Jin-Kao Hao, Zhi-Ping Liu*, Luonan Chen*. Inferring gene regulatory networks from gene expression data by path consistency algorithm based on conditional mutual information. Bioinformatics, 28(1), 98- 104, 2012.  



承担科研项目情况:

特色资源植物基因组的生物信息学分析,中国科学院“百人计划”项目,2016-2019;

基于生物信息学的植物复杂性状的关键基因挖据,中国科学院创新项目,2016-2019;